非晶合金变压器的核心部件是用厚度仅约0.025毫米的极薄非晶带材卷绕而成的铁芯，这种材料的磁滞损耗极低，空载损耗仅为同容量硅钢变压器的25%至35%。但正因为铁芯材料又薄又脆，对机械应力和外部冲击的敏感度远高于传统硅钢铁芯。不少用户对此存在两极分化：一方认为“这变压器太娇气，根本不敢碰”，另一方则觉得“厂家危言耸听，该怎么装就怎么装”。厘清哪些环节需要特殊保护，是正确使用非晶合金变压器的第一步。
运输阶段是第一个需要重点管控的环节。非晶合金铁芯在出厂时虽然已经被夹紧固定，但长途运输中的颠簸和急刹车仍可能使铁芯片发生微观位移甚至碎片脱落。运输前必须确认变压器本体已采用有效的减震固定措施，运输车辆应选择空气悬挂车型，行驶中避免急刹急转。变压器抵达现场后，建议用兆欧表测量铁芯对地绝缘电阻，与出厂报告比对判断铁芯绝缘状态是否完好，发现数值明显下降应通知制造商介入。
安装就位环节同样不可大意。非晶合金变压器一般采用整体吊装方式，吊点位置必须严格按照制造商标注或说明书的规定选取，严禁将吊绳穿入非专用吊点借力起吊。就位时动作要平缓，避免单侧先着地造成铁芯承受扭转应力。安装在振动源附近（如冲压车间、压缩机旁）的变压器，建议在基础台座下加装减震垫，阻断外部振动通过基础传导至铁芯。
投运前的冲击合闸是被很多用户忽视的环节，但对非晶合金变压器却十分关键。空载合闸瞬间会产生幅值可达额定电流6至8倍的非对称励磁涌流，这个涌流产生的巨大电动力如果直接冲击脆硬的非晶铁芯，明显增加铁芯受损风险。投运前应确认继电保护装置已正确整定，首次送电尽可能选择在电网电压平稳时段进行。若现场条件允许，可通过串联电阻等方式减小首次合闸涌流冲击。
还有一点需要澄清：非晶合金变压器“怕短路”是误传。变压器短路承受能力取决于绕组设计和制造工艺，与铁芯材质无直接关系。符合国标型式试验要求的非晶变压器，其短路耐受能力与同容量硅钢变压器处于同等水平，无需特殊降低保护整定值。
非晶合金变压器确实需要在运输和安装环节给予多一分的细致和耐心，但这不等于它在正常运行中也“体弱多病”。把运输减震、均匀就位、控制投切涌流这三件事做到位，它就能以极低的空载损耗长期稳定运行。