箱式变电站发生内部故障时，操作人员面临的情境比传统敞开式变电站复杂得多：设备间距小、检修空间窄、多个电压等级设备共处一箱或相邻箱室，隔离操作的任何一个步骤出错都可能造成严重事故。由于各厂家箱变结构存在差异，通用操作规则之外，每个现场人员还必须对自己管辖箱变的一次系统图和箱室分隔方式烂熟于心。
首先要从思想上明确基本原则：隔离操作的目标是让待检修设备两侧均有“可见断开点”并可靠接地。对于箱变而言，高压进线侧通常有两种情况：由架空线供电的箱变，跌落式熔断器或柱上隔离开关断开后本身就能形成明显断开点；由电缆供电的箱变，必须在电缆头处验明无压后合上接地刀闸，若箱内未配置接地刀闸，则必须使用验电器确认无压后再挂接地线。无论哪种情况，都严禁在未验电的情况下信任任何指示信号。
当故障发生在变压器本体，需要将变压器隔离检修时，操作顺序应当是：先断开低压侧所有出线断路器，将低压总断路器摇至试验位置或拉出柜外并合上低压侧接地刀闸；然后断开高压侧负荷开关或断路器，确认其分闸到位并锁定，合上高压侧接地刀闸或在高压电缆头处验电后挂接地线。高低压两侧都完成隔离接地后，在操作把手处悬挂“禁止合闸，有人工作”标识牌。这里有个易错点：部分箱变高低压室共用一扇检修门或相邻极近，操作人员切记在进入任何箱室前，必须逐一确认该箱室内所有带电设备均已隔离。
当故障发生在高压柜内或高压电缆头，操作步骤是从上一级电源切断——断开箱变前端高压送出开关，在其出线侧验电并挂接地线，然后打开箱变高压室门，对高压柜进线侧验电并加挂接地线后方可实施检修。
当故障发生在低压出线断路器或母线时，只需断开高压侧负荷开关并锁定（变压器停电），低压侧按前述步骤隔离即可。变压器因只有高压侧一个电源点，高压侧隔离后变压器整体处于无电状态，操作相对简单。
有几个必须强调的细节：其一，任何操作切换前，必须核对设备名称、编号和位置，这是防止走错间隔的最后防线；其二，发生故障后隔离操作必须两人进行，一人操作、一人监护；其三，如果箱变内部出现过弧光短路，门板可能已经变形，开门前需确认门板不带电，必要时使用绝缘杆远距操作门锁。
隔离操作技术的核心在于：验证断电并做好接地保护措施，牢记并严格执行操作顺序和规程，在每个可能带电的环节多想一步、多确认一次。这些看似烦琐的程序，保护的是我们自己的生命安全。