倒置式屋面保温是把保温层铺在防水层之上，让防水层受到保温层的物理保护。这种构造对保温材料的吸水率和抗压强度有比外墙更高的要求。石墨聚苯板可以用在倒置式屋面，但有几个细节需要处理。
吸水率是要关注的指标。石墨聚苯板吸水率比挤塑板高一些，这是材料结构决定的。用在倒置屋面时，保温层长期暴露在雨水和屋面排水中，如果板材吸水率偏高，吸水后保温性能下降。选择用于倒置式屋面的石墨聚苯板，应选用低吸水率型号，或采购时向厂家确认是否适用于倒置屋面工况。
还有一个容易被忽略的问题是板材的浮力。倒置式屋面保护层一般是卵石或预制板，如果保温板密度低且闭孔结构多，在暴雨积水时可能存在轻微浮力，导致保护层局部移位。对于石墨板的密度选择，用于倒置屋面时建议选密度稍高的规格，增加自身的稳定性。
石墨聚苯板深色的表面在屋面暴晒下吸热较多，板材本身温度升高。屋面保温层表面温度高对室内隔热是不利因素。倒置屋面用石墨聚苯板时，板材上面应尽快铺设保护层，在保护层未铺之前避免板材长期裸露暴晒。保护层用浅色材料或预制块，能反射部分太阳热量。
板材的铺设方式与普通屋面保温相同，板缝错缝排布，上下层错缝铺贴。倒置式屋面用石墨聚苯板的优势是比挤塑板成本略低，同时保温效果比传统白板好。前提是选对吸水率合适的型号、密度匹配、保护层及时铺设。